Characterization and Prediction of Protein Flexibility Based on Structural Alphabets
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Characterization and Prediction of Protein Flexibility Based on Structural Alphabets
Motivation. To assist efforts in determining and exploring the functional properties of proteins, it is desirable to characterize and predict protein flexibilities. Results. In this study, the conformational entropy is used as an indicator of the protein flexibility. We first explore whether the conformational change can capture the protein flexibility. The well-defined decoy structures are con...
متن کاملProtein flexibility in the light of structural alphabets
Protein structures are valuable tools to understand protein function. Nonetheless, proteins are often considered as rigid macromolecules while their structures exhibit specific flexibility, which is essential to complete their functions. Analyses of protein structures and dynamics are often performed with a simplified three-state description, i.e., the classical secondary structures. More preci...
متن کامل: the effect of sericin levels (silk glue protein) on rate of in vitro maturation, fertilization and culture of sheep oocytes
هدف از آزمایش اول بررسی اثر سطوح مختلف سریسین [0 (control), 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 %] افزوده شده به محیط , ivm بر cumulus cell expansion، بلوغ هسته و توسعه متوالی جنین، در گوسفندان نژاد سنجابی در فصل تولید مثلی می باشد. از سرگیری میوز به وسیله خارج شدن اولین پولار بادی اندازه گیری و هم چنین درصد رسیدن جنین های دو سلولی به مرحله کلیواژ و بلاستوسیت نیز به عنوان نشانه ای از میزان شایستگی توسعه اولیه ج...
synthesis and characterization of some macrocyclic schiff bases
ماکروسیکلهای شیف باز از اهمیت زیادی در شیمی آلی و دارویی برخوردار می باشند. این ماکروسیکلها با دارابودن گروه های مناسب در مکانهای مناسب می توانند فلزاتی مثل مس، نیکل و ... را در حفره های خود به دام انداخته، کمپلکسهای پایدار تولید نمایند. در این پایان نامه ابتدا یک دی آلدئید آروماتیک از گلیسیرین تهیه می شود و در مرحله بعدی واکنش با دی آمینهای آروماتیک و یا آلیفاتیک در رقتهای بسیار زیاد منجر به ت...
15 صفحه اولDesigning succinct structural alphabets
MOTIVATION The 3D structure of a protein sequence can be assembled from the substructures corresponding to small segments of this sequence. For each small sequence segment, there are only a few more likely substructures. We call them the 'structural alphabet' for this segment. Classical approaches such as ROSETTA used sequence profile and secondary structure information, to predict structural f...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: BioMed Research International
سال: 2016
ISSN: 2314-6133,2314-6141
DOI: 10.1155/2016/4628025